氫氧化鎂是一種經濟的選擇，而且不容易沉積，流動性好，用泵運輸方便，易于儲存。工業廢水的傳統方式通常分為兩類。第一種是通過化學方法將溶解的重金屬轉化為不相容的重金屬化合物。第二個是在不改變重金屬化學形式的情況下進行濃縮和分離。由于其較大的比表面積和溶解度，氫氧化鎂通常用于與工業廢水反應并吸收重金屬，如Fe2 +，Zn2 +，Ni2 +，Cd2 +，Mn2 +，Cu2 +，Cr3 +和Cr6 +。由于可以將氫氧化鎂制成濾床或填充到交換塔中，因此當廢水流過時，重金屬將被氫氧化鎂吸收。

氫氧化鎂還可以中和廢水中的酸，無論與哪種酸性物質反應，氫氧化鎂的pH值均在9以內，如果使用其他溶液，pH值將太高。即使在中和過程中用于中和硫酸和吸收重金屬，它也不會結垢，而且，由于氫氧化鎂沒有腐蝕性，并且完全無毒無害，因此無需使用防腐設備。  廢水中的氨和磷影響海洋生物的生命，這將導致藻類富營養化。因此，使用氫氧化鎂去除廢水中的氨和磷非常必要。